期刊：Nature Genetics
IF：31.7
发表时间：2024 Dec 10
文章简介：
本研究通过对非小细胞肺癌（NSCLC）患者在化疗联合免疫治疗前后的单细胞和空间转录组数据进行分析，发现肿瘤细胞与特定巨噬细胞和癌症相关成纤维细胞（CAFs）的相互作用促进了肿瘤边界处胶原纤维的沉积和纠缠，阻碍了T细胞的浸润，并与预后不良相关。此外，研究还揭示了TME中三级淋巴结构（TLSs）的不同状态，其中激活的TLSs与预后改善相关，而缺氧微环境似乎抑制了TLSs的发展，并与预后不良相关。
样本策略：
研究纳入了19名未携带EGFR/ALK突变且接受了新辅助ICB-化疗（PD-1抑制剂加上铂类化疗）的NSCLC患者，其中单细胞测序共26例，空间转录组共19例。
应用技术：
scRNA-seq，Spatial transcriptomics，GeoMx Digital Spatial Profiler。
研究亮点：
(1) 揭示治疗前的肿瘤细胞状态与NSCLC患者对ICB-化疗的反应性有关联。NRF2高水平表达的肿瘤细胞与不良预后相关，而IFNγ高水平表达与良好预后相关。
(2) 揭示了肿瘤细胞和COL11A1+ CAFs在肿瘤边界处相互作用，促进胶原纤维的沉积和纠缠，这一过程阻碍了T细胞的浸润，并与不良预后相关。
(3) 识别了TME中TLSs的不同成熟状态，并探讨了其与治疗反应和预后的相关性。
研究意义：
本研究提供了关于NSCLC患者对ICB-化疗反应不同细胞和分子组分的新见解，有助于未来个体化免疫化疗的发展，并可能指导新的联合治疗方案的开发。
文献原文（DOI）：10.1038/s41588-024-01998-y
原文链接：科研最前沿 | 多组学分析揭示非小细胞肺癌对化疗联合免疫治疗耐药性相关因素